他摒弃了“力”、“气”、“阴阳”等传统哲学化、模糊化的概念，直接从“万物皆由微粒构成”（朴素的原子论）的假设出发，定义了一系列基本物理量和概念：物质、质量（他用“质重”来表述）、空间、时间、运动、速度、力（明确其作用是改变物体运动状态的原因）、杠杆、滑轮、斜面、浮力、压强、热（定义为一种能量形式，而非神秘的“火气”）、光的直线传播、声音的产生与传播等。每一概念都配有清晰的定义、简易的测量方法（如用天平测质量、用滴漏计时、用自制尺规测量）和可亲手操作的实验来验证。例如，为了证明大气压的存在，他设计了着名的“马德堡半球”实验的简易版；为了展示杠杆原理，让学员用不同长度的棍棒撬动重物。

编写的过程并非易事。他需要时刻警惕，避免触及“神权”或直接挑战“天理”等儒家核心哲学观念。他绝不讨论世界本源是“理”还是“气”，也不涉及宇宙的终极目的。他只描述可观察、可测量、可重复验证的自然现象及其之间的数学关系，只写“是什么”和“怎么做”，尽量避免“为什么”的终极追问。他将自己的角色严格限定在一个“自然规律的总结者和阐述者”上，而非哲学家或神学家。

夜以继日，书房内的灯火常常亮至天明。写废的稿纸堆积如山，又被小心地收集起来，由亲信统一焚毁，以防未成熟的思想流出引起不必要的波澜。陆仁沉浸在对前世知识的回忆、梳理、转化和再创造之中，感觉自己也仿佛重新接受了一次系统的科学洗礼。

数日后，《初级算术》与《初级物理》的初稿终于完成。虽然只是薄薄的两册，却仿佛重若千钧。陆仁立即召集格物学院的骨干教员和优秀学员，将新教材下发。

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起初，学员们对这两本装帧简单、却散发着油墨清香的册子感到十分好奇。尤其是封面上那醒目的“初级”二字，让他们有些不解——自己好歹也识文断字，甚至有些还粗通经义，为何还要学“初级”？

然而，当他们翻开书页，立刻被一种全新的表达方式吸引住了。清晰的“格数”符号、简洁的公式、直观的图示、以及那些要求他们亲手去试一试的“实验”！这完全不同于他们以往读过的任何一本圣贤书或匠作图谱。

“先生，这‘格数’写起来果真简便！”

“原来用力的大小不仅可以感觉，还能用砝码来比较测量？”

“两个铁半球竟然真的被‘气’压住了，八匹马都拉不开？这…这气竟有如此巨力？”

“同样重的石头，体积不同，为何在水中沉浮不一样？”

实证堂内，瞬间变成了一个巨大的好奇宝宝乐园。学员们根据书中的指导，兴致勃勃地动手制作简易天平、测量杆、滑轮组、杠杆、浮力秤……他们一遍遍地重复着实验，验证着书中的每一个结论。当实验结果与书中所写完全吻合时，他们眼中迸发出恍然大悟的明亮光彩，发出阵阵惊叹。那种通过亲手实践、确凿无误地掌握了一个自然规律所带来的成就感和愉悦感，是死记硬背任何圣贤之言都无法给予的。

格物学院迎来了一次真正意义上的教学革命。学习不再仅仅是听讲和模仿，而是变成了观察、提问、假设、实验、验证、总结的完整过程。学员们的思维被极大地激活了，他们开始尝试用书中的原理去解释生活中遇到的各种现象，甚至有人开始对蒸汽机的某些细节提出改进的设想，虽然稚嫩，却方向正确。

陆仁穿梭于实证堂，看着这群年轻的头脑在他的引导下迸发出思维的火花，感到无比的欣慰。他知道，《中级》和《高级》的教程将逐步引入更复杂的代数、几何、三角学、运动力学、热力学乃至初步的化学知识，道路漫长且艰难，但第一步，已经坚实迈出。一套基于实证和逻辑的、全新的知识体系，正在西山的土壤里悄然生根发芽。

就在学院上下沉浸在这场知识革新的热潮中时，一日下午，门子匆匆来到实证堂外，找到了正在指导学员进行浮力实验的陆仁。

“禀大人，西山辕门外，有一年轻书生求见。”门子恭敬地说道。

陆仁正专注于一个学员关于“空心铁船为何能浮”的提问，头也没抬，随口问道：“可问了姓名、籍贯、来意？”

“问了。那人约莫二十出头年纪，穿着朴素青衫，风尘仆仆，自称姓王，名守仁，字伯安，浙江余姚人士。说是…说是游学至此，听闻西山格物之名，特来拜访请教。”门子如实回报。